Eine mittelalterliche Kirche, die San Biagio in Finalborgo gewidmet ist, wird erstmals 1261 dokumentiert, als Giacomo del Carretto den Männern von Rialto die Nutzung der Wälder an den Hängen des Melogno gewährte. FünfzigJahre später, in den mittelalterlichen Statuten des Finale von 1311, wurden Strafen für diejenigen festgelegt, die in der Kirche und auf dem nahe gelegenen Friedhof gespielt oder unangemessene Haltungen eingenommen hatten.

Dieses erste Kultgebäude mit dem angrenzenden Krankenhaus befand sich am Ostufer des Flusses Aquila, außerhalb der Stadtmauern des Borgo del Finale und wurde daher das San Biagio extra-muros genannt.

Im Jahr 1372 beschloss die Gemeinschaft des Dorfes, die Kirche innerhalb der Mauern zu verlegen. Die neue Kirche, die bereits 1375 praktisch fertiggestellt wurde, entstand in der Nähe der Brücke, in Übereinstimmung mit den Mauern, am Eingang des Dorfes

Nach der radikalen Rekonstruktion aus dem 17. Jahrhundert sind von der mittelalterlichen Kirche nur der polygonale Apsisteil, der aus den Ringmauern des Dorfes herausragt, und der prächtige Glockenturm, der um 1463 auf einem halbrunden Turm errichtet wurde, erhalten.

Im Jahr 1571 wurde die Kirche von deutschen Soldaten geplündert, die vom Kaiser geschickt wurden, um die Besetzung des Markgrafen von Finale durch Genua zu verhindern.

Nach der Übergabe des Finale an Spanien im Jahr 1602 beschloss der Generalrat der Gemeinschaft des Borgo den Bau einer neuen und grandiosen Basilika. Die barocke Kirche, die 1634 nach einem Entwurf des finalen Architekten Andrea Storace begonnen wurde, wurde erst 1659 fertiggestellt und 1690 endgültig geweiht.

Die neue Basilika bestand aus drei Schiffen mit großen Säulen und hatte ein Kreuzsystem mit einer Kuppel an der Kreuzung des Querschiffs.

In den folgenden Jahren wurde die Kirche mit Altären bereichert, die sich an den Seiten des Querschiffs und an den Seiten der Seitenschiffe befanden. 1765 stammt die Kanzel aus weißem Marmor, ein Originalwerk des genuesischen Bildhauers Pasquale Bocciardo, während seinem Sohn Girolamo Bocciardo die prächtige Balustrade mit Engeln, die die eucharistische Tischdecke halten, und in Zusammenarbeit mit Andrea Casareggio den Hauptaltar zu verdanken ist.

Nach der endgültigen Abschaffung der Dominikanerkirche Santa Caterina in Finalborgo im Jahr 1864 wurden viele ihrer Marmoraltäre und prestigeträchtigen Gemälde nach San Biagio verlegt.

Auch das Marmormausoleum des letzten Marquis Sforza Andrea Del Carretto, das 1604 von Battista Orsolino für das Presbyterium der Dominikanerkirche ausgeführt wurde, wurde an die Außenfassade der Pfarrkirche verlegt.

Auf diese Weise wurde die Basilika San Biagio zu einer herrlichen Kirche, die in Ligurien aufgrund des Reichtums ihrer Altäre und der hohen Qualität der darin aufbewahrten Gemälde wenig Vergleiche aufweist.

Die Fresken im Inneren der Kuppel, des Gewölbes des Kirchenschiffs und des Presbyteriums wurden von verschiedenen Künstlern zwischen 1870 und 1911 ausgeführt.